Environ 1000 incidents de paiement ont été signalés, sur Voyages-Sncf.com, depuis début 2006, selon le Parisien/Aujourd’hui en France. Sur le seul mois d’octobre, l’entreprise en a recensé 300, correspondant à des problèmes informatiques. Le site indiquait « échec de la transaction », incitant les internautes a renouvelé le paiement alors qu’il avait été bien pris en compte la première fois par le site. Voyages-Sncf.com a pris contact avec l’ensemble des clients concernés. En 2005 Voyages-Sncf.com avait relevé 932 incidents sur 25 millions de transactions.